Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms