Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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PtprfA2A8L5 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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PtprfA2A8L5 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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PtprfA2A8L5 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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PtprfA2A8L5 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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