Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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