Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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CcniQ9Z2V9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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CcniQ9Z2V9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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CcniQ9Z2V9 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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