Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Cldn6Q9Z262 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Cldn6Q9Z262 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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Cldn6Q9Z262 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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