Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms