Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUT7

Ccr9, C-C chemokine receptor type 9, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr9Q9WUT7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccr9Q9WUT7 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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