Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP3

Spdef, SAM pointed domain-containing Ets transcription factor, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpdefQ9WTP3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SpdefQ9WTP3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SpdefQ9WTP3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SpdefQ9WTP3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SpdefQ9WTP3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SpdefQ9WTP3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SpdefQ9WTP3 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SpdefQ9WTP3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SpdefQ9WTP3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SpdefQ9WTP3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SpdefQ9WTP3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SpdefQ9WTP3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SpdefQ9WTP3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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