Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Col4a3Q9QZS0 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Col4a3Q9QZS0 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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