Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ripk3Q9QZL0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ripk3Q9QZL0 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ripk3Q9QZL0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms