Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms