Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Rabgef1Q9JM13 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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Rabgef1Q9JM13 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Rabgef1Q9JM13 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Rabgef1Q9JM13 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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