Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Gde1Q9JL56 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Gde1Q9JL56 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Gde1Q9JL56 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gde1Q9JL56 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gde1Q9JL56 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gde1Q9JL56 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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