Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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