Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Chrac1Q9JKP8 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Chrac1Q9JKP8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Chrac1Q9JKP8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Chrac1Q9JKP8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Chrac1Q9JKP8 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms