Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms