Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC69

Ndufa9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa9Q9DC69 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufa9Q9DC69 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufa9Q9DC69 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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