Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Hmg20aQ9DC33 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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