Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Csnk1dQ9DC28 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Csnk1dQ9DC28 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Csnk1dQ9DC28 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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