Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf6Q9DBU5 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf6Q9DBU5 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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