Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tmem43Q9DBS1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms