Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms