Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms