Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Capns2Q9D7J7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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