Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6S7

Mrrf, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MrrfQ9D6S7 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
MrrfQ9D6S7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms