Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms