Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms