Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Zbed3Q9D0L1 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Zbed3Q9D0L1 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Zbed3Q9D0L1 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Zbed3Q9D0L1 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Zbed3Q9D0L1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Zbed3Q9D0L1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Zbed3Q9D0L1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Zbed3Q9D0L1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Zbed3Q9D0L1 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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