Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Mms19Q9D071 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Mms19Q9D071 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Mms19Q9D071 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Mms19Q9D071 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Mms19Q9D071 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Mms19Q9D071 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Mms19Q9D071 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Mms19Q9D071 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Mms19Q9D071 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Mms19Q9D071 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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