Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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