Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shmt2Q9CZN7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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