Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrs1Q9CYH6 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms