Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gins3Q9CY94 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms