Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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