Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms