Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Pfdn1Q9CWM4 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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