Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms