Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ykt6Q9CQW1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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