Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms