Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PsenenQ9CQR7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms