Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 374 ms