Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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