Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms