Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SrrtQ99MR6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SrrtQ99MR6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrrtQ99MR6 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms