Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms