Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms