Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms