Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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