Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn16Q925N4 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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