Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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